在一块大石头的旁边，立有一块元和基督徒遗址的石碑和一块说明牌。 这里是江户第三代将军德川家光在元和9年处死50名基督徒的地方，据说，15年后又有基督徒在同一个地方被处死。以这里为舞台， 围绕主人公“男”和名叫“鼠”的修道士之间的故事，远藤周作创作了短篇小说《札辻》。

根据社传记载，本神社早在平安时代中叶就供奉有伊势宫的分灵，是都内有名的古社。芝大神宫之名始于明治时代之后，此前被称为饭仓神明宫、芝神明宫等。从芝的神明首先联想到的是，文化2年2月在神明境内进行的四车大八、水引清五郎等人的劝进相扑与管辖这一区域的消防组织惠组的高空作业人员之间产生的“惠组的喧哗”，但神明宫门前在当时的港区也是赫赫有名的繁华街。江户时代，寺庙、神社内允许从事相扑、戏剧活动，本社因此日渐兴盛。本社的戏剧作为江户三宫戏剧之一，据说在芝神明宫境内最早上演的戏剧可追溯到正保2年（1645年）。每年9月举行的“磨磨蹭蹭祭”据称是因其举办时间长而得名，又因祭典中在神社内和附近生姜大卖而得名“生姜市”，乃是与小传马町的"腌萝卜市"齐名、甚至在浮世绘中也描绘过的江户庶民庆典之一。祭典期间，神社内售卖生姜、千木筥（箱）、甜酒。千木筥（箱）是一种小判形状的枪割笼，据称可以避雷，又因“千木”与“千着”相近，据称放在抽屉里衣服就会变多。为了纪念不动储蓄银行的创始人牧野元次郎的功绩，阶梯下建有贮金冢

荷兰人休斯肯于安政3年7月与哈里斯一起来到下田，作为他的左膀右臂，在日美友好通商条约缔结谈判中发挥了重要的作用，现而今他的墓就在此处（区史迹）。出生于阿姆斯特丹的休斯肯在美国留学时，因具有出色的德语、法语等语言能力从而被哈里斯赏识一同前往日本赴任。他以开朗豁达的气质和熟知日本国情的见识，成为旅居江户的外国人中的知名人士。然而在为普鲁士使节和日方沟通翻译时，在从赤羽根招待所回来的路上，于中之桥桥边上遭到了一群刺客的袭击。1861年1月15日去世，享年28岁。另外，虽然昔日被誉为都下第一名花的老樱现在已经不存在了，但一到春天，神社院内的樱花、木莲就会争奇斗艳开出美丽的花朵。

英国的首任公使阿礼国和第二任公使巴夏礼曾将东禅寺作为公使旅馆使用。虽然屡次遭到攘夷派流浪武士的袭击，但书院内部和入口仍保留了当时的原貌。